Enzimler

tanım

Enzimler vücudun her yerinde bulunabilen kimyasal maddelerdir. Vücutta kimyasal reaksiyonları harekete geçirirler.

Tarih

Kelime enzim -dan Wilhelm Friedrich Kühne 1878 ve Yunanca maya veya maya anlamına gelen enzimon kelimesinden türetilmiştir. Bu daha sonra uluslararası bilime girdi. uluslararası saf uygulamalı kimya birliği (IUPAC) ve uluslararası biyokimya birliği (IUBMIB) enzimler için bu büyük madde grubunun temsilcilerini ortak bir grup olarak tanımlayan bir isimlendirme geliştirdi. Enzimleri görevlerine göre sınıflandıran isimlendirme, tek tek enzimlerin görevlerinin belirlenmesi açısından önemlidir.

Enzimlerin gösterimi

Enzimler
6 enzim sınıfı:

1. oksidoredüktazlar
   (Oksidasyon redüksiyon)
2. Transferazlar
   (Bulaşma)
3. hidrolazlar
   (Su kullanımı)
4. lizazlar
   (Bölünmesi)
5. İzomerazlar
   (aynı moleküler formül)
6. ligazlar
   (Ekleme reaksiyonları)
7. Substratlar
8. Aktif merkez
9. Enzim / substrat
   karmaşık
10. Enzim / ürün
    karmaşık

Hepsine genel bir bakışDr-Gumpert'ın resimleri şu adreste bulunabilir: tıbbi resimler

Adlandırma

Adlandırma enzim açık üç temel ilke tabanlı.-Ase ile biten enzim isimleri, bir sistemdeki birkaç enzimi tanımlar. Enzim adının kendisi, enzimin harekete geçirdiği reaksiyonu tanımlar (katalize). Enzim adı aynı zamanda enzimin bir sınıflandırmasıdır. Ek olarak, bir kod sistemi EC sayı sistemienzimlerin sayısal bir kod altında yapıldığı dört numara bulunabilir. İlk sayı enzim sınıfını gösterir. Tespit edilen tüm enzimlerin listeleri, belirtilen enzim kodunun daha hızlı bulunabilmesini sağlar. Kodlar, enzimin katalize ettiği reaksiyonun özelliklerine dayansa da, pratikte sayısal kodlar kullanışsızdır. Yukarıdaki kurallara dayalı sistematik isimler daha sık kullanılır. Örneğin, birkaç reaksiyonu katalize eden enzimlerle ilgili terminoloji sorunları ortaya çıkar. Bu nedenle, bazen onlar için birkaç isim vardır. Bazı enzimlerin, bahsedilen maddenin bir enzim olduğunu göstermeyen önemsiz isimleri vardır. İsimler geleneksel olarak yaygın olarak kullanıldığından bazıları muhafaza edildi.

Enzim fonksiyonuna göre sınıflandırma

IUPAC ve IUBMB'ye göre enzimler başlattıkları reaksiyona göre altı enzim sınıfına ayrılır:

• oksidoredüktazlar
  Oksidoredüktazlar, redoks reaksiyonlarını harekete geçirir. Bu kimyasal reaksiyonda elektronlar bir reaksiyon ortağından diğerine geçer. Bir maddenin elektron salınımı (oksidasyon) ve başka bir madde tarafından elektron alımı (indirgeme) vardır.
  Katalize reaksiyonun formülü A ?? + B? A? + B? Dir.
  A maddesi bir elektron (?) Salar ve oksitlenir, B maddesi bu elektronu emer ve indirgenir. Redoks reaksiyonlarına indirgeme-oksidasyon reaksiyonları da denmesinin nedeni budur.
  Çoğu metabolik reaksiyon, redoks reaksiyonlarıdır. Oksijenazlar, bir veya daha fazla oksijen atomunu substratlarına aktarır.
• Transferazlar
  Transferazlar, fonksiyonel grubu bir substrattan diğerine aktarır. Fonksiyonel gruplar, organik bileşiklerdeki, madde özelliklerini ve reaksiyon davranışını büyük ölçüde belirleyen atomik gruplardır. Aynı fonksiyonel gruplara sahip kimyasal bileşikler, benzer özelliklerinden dolayı madde sınıflarına ayrılır. Fonksiyonel gruplar heteroatom olup olmadıklarına göre bölünecektir. Heteroatomların tümü, ne karbon ne de hidrojen olmayan organik bileşikler içindeki atomlardır.
  Örneğin: -OH -> hidroksil grubu (alkoller)
• hidrolazlar
  Hidrolazlar su kullanarak tersinir reaksiyonlarda bağları böler. Esterler, esterler, peptitler, glikozitler, asit anhidritler veya C-C bağları. Denge reaksiyonu: A-B + H2O? A-H + B-OH.
  Hidrolazlar grubuna ait bir enzim, örn. Alfa galaktosidaz.
• lizazlar
  Sentazlar olarak da adlandırılan liyazlar, karmaşık ürünlerin ATP'yi ayırmadan basit substratlardan ayrılmasını katalize eder. Reaksiyon şeması A-B → A + B şeklindedir.
  ATP, adenozin trifosfat ve nükleosid adenozinin trifosfatından (ve dolayısıyla nükleik asit RNA'nın enerji açısından zengin bir yapı bloğundan) oluşan bir nükleotiddir. Bununla birlikte, ATP esas olarak her hücrede hemen mevcut olan enerjinin evrensel formudur ve aynı zamanda enerji tedarik süreçlerinin önemli bir düzenleyicisidir. Gerekirse, ATP diğer enerji depolarından (kreatin fosfat, glikojen, yağ asitleri) yeniden sentezlenir. ATP molekülü, bir adenin kalıntısı, şeker ribozu ve ester (?) Veya anhidrit bağlarında (? Ve?) Üç fosfattan (? To?) Oluşur.
• İzomerazlar
  İzomerazlar, izomerlerin kimyasal dönüşümünü hızlandırır. İzomerizm, tam olarak aynı atomlara (aynı ampirik formül) ve moleküler ağırlıklara sahip iki veya daha fazla kimyasal bileşiğin oluşmasıdır, ancak bunlar atomların bağlantısında veya uzamsal düzeninde farklılık gösterir. Karşılık gelen bileşiklere izomerler denir.
  Bu izomerler, kimyasal ve / veya fiziksel ve sıklıkla biyokimyasal özellikleri bakımından farklılık gösterir. İzomerizm, öncelikle organik bileşiklerle, ancak aynı zamanda (inorganik) koordinasyon bileşikleriyle de oluşur. İzomerizm farklı alanlara ayrılmıştır.
• ligazlar
  Ligazlar, kullanılan substratlardan kimyasal olarak daha karmaşık olan maddelerin oluşumunu katalize eder, ancak liyazların aksine, ATP bölünmesi ile sadece enzimatik olarak etkilidir. Bu maddelerin oluşumu, bu nedenle ATP'nin bölünmesiyle elde edilen enerjiyi gerektirir.

Bazı enzimler birkaç, bazen çok farklı reaksiyonları katalize edebilir. Durum böyleyse, birkaç enzim sınıfına atanırlar.

Şu makaleler de ilginizi çekebilir:

• Alfa-glukozidaz
• lipaz
• Tripsin

Enzim yapısına göre sınıflandırma

Hemen hemen tüm enzimler proteindir ve protein zinciri uzunluğuna göre sınıflandırılabilir:

• Monomerler
  Sadece bir protein zincirinden oluşan enzimler
• Oligomerler
  Birkaç protein zincirinden (monomerler) oluşan enzimler
• Çok enzimli zincirler
  İşbirliği yapan ve birbirini düzenleyen birkaç kümelenmiş enzim. Bu enzim zincirleri, hücrenin metabolizmasında birbirini izleyen adımları katalize eder.

Ek olarak, çeşitli enzim aktiviteleri içeren ayrı protein zincirleri vardır; bunlara çok işlevli enzimler denir.

Kofaktörlere göre sınıflandırma

Diğer bir sınıflandırma, kofaktörlerin değerlendirmesine göre yapılan sınıflandırmadır. Kofaktörler, koenzimler ve yardımcı substratlar, enzimlerle etkileşimleri yoluyla biyokimyasal reaksiyonları etkileyen çeşitli madde sınıflandırmalarının isimleridir.
Organik moleküller ve iyonlar (çoğunlukla metal iyonları) dikkate alınır.

Saf protein enzimleri yalnızca proteinlerden oluşur ve aktif merkez yalnızca amino asit kalıntılarından ve peptit omurgasından oluşur. Amino asitler, en az bir karboksi grubu (-COOH) ve bir amino grubu (-NH2) içeren bir organik bileşikler sınıfıdır.

Holoenzimler, bir protein bileşeni, apoenzim ve bir kofaktör, düşük moleküler ağırlıklı bir molekülden (protein değil) oluşur. İkisi birlikte enzimin işlevi için önemlidir.

Koenzimler
Kofaktör olarak organik moleküller koenzimler olarak adlandırılır. Apoenzime kovalent olarak bağlanırlarsa, protez grupları veya ko-substratlar olarak adlandırılırlar. Bir protez grubu, katalitik etkiye sahip bir proteine ​​sıkıca (genellikle kovalent olarak) bağlanmış protein olmayan bileşenleri tanımlamak için kullanılan terimdir.

Kosubstratlar, enzimlerle etkileşimleri yoluyla biyokimyasal reaksiyonları etkileyen çeşitli madde sınıflandırmalarının isimleridir. Biyokatalizörler olarak, moleküller organizmalardaki reaksiyonları hızlandırır, enzimler biyokimyasal reaksiyonları hızlandırır. Maddenin dönüştürülebilmesi için aşılması gereken aktivasyon enerjisini azaltırlar.